O rio Côa tem um caudal bastante instável, com cheias a ocorrer nos períodos de chuva, e grande secas nos meses de verão. Ao acompanhá-lo da nascente à foz, é natural que surjam zonas alagadas durante o inverno.
Neste momento existem várias zonas de possível alagamento ao longo da GRVC, especialmente nas etapas no concelho do Sabugal e Almeida. Em cada ficha de etapa .pdf poderá encontrar assinalado no mapa.